| 【監修者】 |
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| 服部 正平 | 早稲田大学理工学術院先進理工学研究科 教授 |
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| 【執筆者】計99名（執筆順・敬称略） |
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| 服部 正平 | 早稲田大学理工学術院先進理工学研究科 教授 |
| 緒方 勇亮 | 国立研究開発法人理化学研究所生命医科学研究センターマイクロバイオーム研究チーム 特別研究員 |
| 須田 亙 | 国立研究開発法人理化学研究所生命医科学研究センターマイクロバイオーム研究チーム 副チームリーダー |
| 飯田 哲也 | 大阪大学微生物病研究所 教授 |
| 金子 慶也 | 東京大学大学院新領域創成科学研究科 |
| 関 真秀 | 東京大学大学院新領域創成科学研究科 特任助教 |
| Lucky R Run tuwene | 東京大学大学院新領域創成科学研究科 特任助教 |
| 鈴木 穣 | 東京大学大学院新領域創成科学研究科 教授 |
| 鈴木 慶彦 | 東京大学大学院新領域創成科学研究科 |
| 西嶋 傑 | 欧州分子生物学研究所構造・計算生物学ユニット |
| 森下 真一 | 東京大学大学院新領域創成科学研究科 教授 |
| 木口 悠也 | 国立研究開発法人産業技術総合研究所産総研・早大生体システムビッグデータ
解析オープンイノベーションラボラトリ リサーチアシスタント／
早稲田大学大学院先進理工学研究科 |
| 福田 真嗣 | 慶應義塾大学先端生命科学研究所 特任教授／
神奈川県立産業技術総合研究所腸内細菌叢プロジェクト グループリーダー ／
筑波大学医学医療系 客員教授／
株式会社メタジェン 代表取締役社長CEO |
| 岡橋 伸幸 | 大阪大学大学院情報科学研究科 准教授／
国立研究開発法人理化学研究所生命医科学研究センター 客員研究員 |
| 上田 政宏 | JSR 株式会社JSR・慶應義塾大学医学化学イノベーションセンター ／
国立研究開発法人理化学研究所生命医科学研究センター 客員研究員 |
| 有田 誠 | 慶應義塾大学薬学部 教授／
国立研究開発法人理化学研究所生命医科学研究センター チームリーダー／
横浜市立大学大学院生命医科学研究科 客員教授 |
| 大津 厳生 | 筑波大学生命環境系 准教授 |
| 川島 祐介 | 公益財団法人かずさDNA 研究所ゲノム事業推進部 研究員 |
| 小原 收 | 公益財団法人かずさDNA 研究所ゲノム事業推進部 部長 |
| 平山 和宏 | 東京大学大学院農学生命科学研究科 教授 |
| 坂本 光央 | 国立研究開発法人理化学研究所バイオリソース研究センター微生物材料開発室
専任研究員／ 国立研究開発法人日本医療研究開発機構 PRIME |
| 森 宙史 | 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構国立遺伝学研究所情報研究系 助教 |
| 黒川 顕 | 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構国立遺伝学研究所情報研究系 教授/副所長 |
| 永田 尚義 | 東京医科大学消化器内視鏡学 准教授 |
| 松木 隆広 | 株式会社ヤクルト本社中央研究所基盤研究所共生システム研究室 室長 |
| 金 倫基 | 慶應義塾大学薬学部 教授 |
| 高安 伶奈 | 東京大学大学院医学系研究科 助教 |
| 加藤久美子 | 森永乳業株式会社研究本部基礎研究所腸内フローラ研究グループ 研究員 |
| 小田巻俊孝 | 森永乳業株式会社研究本部基礎研究所腸内フローラ研究グループ グループ長 |
| 細見 晃司 | 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所ワクチン・アジュバント研究センター
研究員 |
| 國澤 純 | 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所ワクチン・アジュバント研究センター
センター長 |
| 長谷 耕二 | 慶應義塾大学薬学部 教授 |
| 新藏 礼子 | 東京大学定量生命科学研究所 教授 |
| 小川 順 | 京都大学大学院農学研究科 教授 |
| 岸野 重信 | 京都大学大学院農学研究科 准教授 |
| 中本 伸宏 | 慶應義塾大学医学部 准教授 |
| 菊水 健史 | 麻布大学獣医学部 教授 |
| 上村いつか | 麻布大学大学院獣医学研究科 |
| 栃谷 史郎 | 鈴鹿医療科学大学保健衛生学部 准教授 |
| 市川 将隆 | 慶應義塾大学医学部 助教 |
| 筋野 智久 | 慶應義塾大学医学部 専任講師 |
| 金井 隆典 | 慶應義塾大学医学部 教授 |
| 竹内 直志 | 国立研究開発法人理化学研究所生命医科学研究センター 研修生／
慶応義塾大学大学院医学研究科 |
| 中西裕美子 | 地方独立行政法人神奈川県立産業技術総合研究所腸内細菌叢プロジェクト 常勤研究員／
国立研究開発法人理化学研究所生命医科学研究センター粘膜システム研究チーム
客員研究員 |
| 前田 悠一 | 大阪大学大学院医学系研究科 助教 |
| 佐藤和貴郎 | 国立研究開発法人国立精神・神経医療研究センター神経研究所免疫研究部 室長 |
| 山村 隆 | 国立研究開発法人国立精神・神経医療研究センター神経研究所 特任研究部長 |
| 平山 正昭 | 名古屋大学大学院医学系研究科 准教授 |
| 大野 欽司 | 名古屋大学大学院医学系研究科 教授 |
| 福土 審 | 東北大学大学院医学系研究科 教授／東北大学病院心療内科 科長 |
| 吉田 尚史 | 神戸大学大学院医学研究科 医学研究員 |
| 山下 智也 | 神戸大学医学部附属病院循環器内科 准教授 |
| 平田 健一 | 神戸大学大学院医学研究科 教授 |
| 梅井 正彦 | 東京大学大学院医学系研究科 |
| 赤澤 宏 | 東京大学大学院医学系研究科 講師 |
| 功刀 浩 | 帝京大学医学部 教授／国立研究開発法人国立精神・神経医療研究センター神経研究所
客員研究員 |
| 内藤 裕二 | 京都府立医科大学大学院医学研究科 准教授 |
| 髙木 智久 | 京都府立医科大学大学院医学研究科 准教授 |
| 成田 雅美 | 東京都立小児総合医療センターアレルギー科 医長 |
| 下条 直樹 | 千葉大学大学院医学研究院小児病態学 教授 |
| 塩﨑 有宏 | 富山大学附属病院産科婦人科 講師/臨床准教授 |
| 齋藤 滋 | 富山大学 学長 |
| 三島 英換 | 東北大学病院腎高血圧内分泌科 院内講師 |
| 菊地 晃一 | 東北大学東北メディカル・メガバンク機構 助教 |
| 阿部 高明 | 東北大学大学院医工学研究科 教授 |
| 岩田 恭宜 | 金沢大学附属病院感染制御部腎臓内科 特任准教授 |
| 中出 祐介 | 金沢大学附属病院臨床検査部 副技士長 |
| 和田 隆志 | 金沢大学大学院腎臓内科学 教授 |
| 垣花 和彦 | 東京都立駒込病院血液内科 医長 |
| 井上 亮 | 摂南大学農学部 教授 |
| 向山 広美 | 東京農工大学大学院農学研究院 |
| 宮本 潤基 | 東京農工大学大学院農学研究院 特任助教 |
| 木村 郁夫 | 東京農工大学大学院農学研究院 教授 |
| 青木 亮 | 江崎グリコ株式会社健康科学研究所 |
| 山下 喜久 | 九州大学大学院歯学研究院 教授 |
| 竹下 徹 | 九州大学大学院歯学研究院 准教授 |
| 山崎 和久 | 新潟大学大学院医歯学総合研究科 教授 |
| 池田 恵莉 | 東京医科歯科大学大学院医歯学総合研究科 非常勤講師 |
| 竹内 康雄 | 東京医科歯科大学大学院医歯学総合研究科 講師 |
| 東 みゆき | 東京医科歯科大学大学院医歯学総合研究科 教授 |
| 石原 和幸 | 東京歯科大学微生物学講座 教授 |
| 冨田 秀太 | 岡山大学病院ゲノム医療総合推進センター 准教授 |
| 川崎 洋 | 国立研究開発法人理化学研究所科技ハブ産連本部 上級研究員 |
| 天谷 雅行 | 慶應義塾大学医学部 教授 |
| 漆山 大知 | 福岡大学医学部 助教 |
| 秦 健一郎 | 国立研究開発法人国立成育医療研究センター研究所周産期病態研究部 部長 |
| 宮本 新吾 | 福岡大学医学部 主任教授 |
| 米井 嘉一 | 同志社大学大学院生命医科学研究科 教授 |
| HAASBROEK Kyle | 同志社大学大学院生命医科学研究科 |
| 辻 典子 | 国立研究開発法人産業技術総合研究所細胞分子工学研究部門 上級主任研究員 |
| 松本 光晴 | 協同乳業株式会社研究所技術開発グループ 主幹研究員 |
| 庄司 俊彦 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
食品研究部門食品健康機能研究領域 ユニット長 |
| 遠山 忠 | 山梨大学大学院総合研究部/国際流域環境研究センター 准教授 |
| 石澤 秀紘 | 静岡大学グリーン科学技術研究所 日本学術振興会特別研究員 |
| 宮本 浩邦 | 千葉大学大学院園芸学研究科 連携客員教授／
国立研究開発法人理化学研究所生命医科学研究センター 客員主管研究員／
株式会社サーマス CTO |
| 大野 博司 | 国立研究開発法人理化学研究所生命医科学研究センター粘膜システム研究チーム
チームリーダー |
| 児玉 浩明 | 千葉大学大学院生物化学研究室 教授 |
| 島 綾香 | アニコム先進医療研究所株式会社研究開発部 課長/主席研究員 |
| 石原 玄基 | アニコム先進医療研究所株式会社 取締役 |
