ゲノミクス・プロテオミクスの新展開　関連Web-site集-第１編
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第１編　ゲノミクス
第１章　微生物のゲノム解析　[第１章|第２章|第３章]
No.節題サイト名URLページ
1節微生物のゲノム解析　
1大腸菌14
　　奈良先端科学技術大学院大学・遺伝子教育研究センターhttp://gtcw3.naist.jp/　
　　大腸菌のためのpagehttp://ecoli.aist-nara.ac.jp/　
　　慶応大学先端生命科学研究所http://www.ttck.keio.ac.jp　
2大腸菌ゲノムデータベース〜GenoBase, PEC〜21
　　GenoBasehttp://ecoli.aist-nara.ac.jp/　
　　PEChttp://shigen.lab.nig.ac.jp/ecoli/pec/　
3最少必須遺伝子群30
　　Profiling of Escherichia coli chromosome(PEC)http://shigen.lab.nig.ac.jp/ecoli/pec　
4マイクロアレイ解析46
　　ArrayWoRxhttp://biomicro.mit.edu/biofabrication/scanning.htm 　
　　GenePixhttp://www.axon.com/gn_GenePixSoftware.html 　
　　ImaGenehttp://www.biodiscovery.com/imagene.asp　
　　Scan Alyzehttp://rana.lbl.gov/EisenSoftware.htm　
6大腸菌ゲノムDNA複製系64
　　大腸菌ゲノムデータベースhttp://ecoli.aist-nara.ac.jp/　
　　大腸菌ゲノムデータベースhttp://shigen.lab.nig.ac.jp/ecoli/pec/index.jsp　
　　大腸菌ゲノムデータベース（W3110）http://gib.genes.nig.ac.jp/single/index.php?spid=Ecol_K12_W3110　
　　大腸菌ゲノムデータベース（MG1655）http://gib.genes.nig.ac.jp/single/index.php?spid=Ecol_K12_MG1655　
　　AAAファミリータンパク質http://mukb.medic.kumamoto-u.ac.jp/AAA/aaainfo.html　
7大腸菌全遺伝子のクローンセットの作製77
　　大腸菌ゲノムデータベースhttp://ecoli.aist-nara.ac.jp/　
　　　http://mbgd.genome.ad.jp/　
2節枯草菌87
　　SOSUIデータベースhttp://sosui.proteome.bio.tuat.ac.jp/sosuiframe0.html 　
　　BSORFデータベースhttp://bacillus.genome.ad.jp/　
　　KEGGデータベースhttp://www.genome.ad.jp/kegg/expression 　
　　DECODON Delta 2-Dソフトウエアーhttp://www.decodon.com　
3節放線菌　100
　　ゲノム情報：http://avermitilis.ls.kitasato-u.ac.jp　
　　　http://www.sanger.ac.uk/Projects/S_coelicolor/　
　　　http://mbgd.genome.ad.jp/htbin/MBGD_whole_html.pl?spec=sma　
　　　http://gib.genes.nig.ac.jp/single/index.php?spid=Save_MA4680　
　　　http://gib.genes.nig.ac.jp/single/index.php?spid=Scoe_A3　
　　解析法：http://www.nih.go.jp/~jun/research/　
　　データーベース：http://www.npbiogene.com/　
　　　http://www.genome.ad.jp/kegg/　
4節シアノバクテリア112
　　かずさDNA研究所　CyanoBasehttp://www.kazusa.or.jp/cyano/cyano.html　
　　かずさDNA研究所　CyanoMutantshttp://www.kazusa.or.jp/cyano/mutants/　
　　KEGG, Kyoto Encyclepedia of Genes and Genomes : SYORFhttp://cyano.genome.ad.jp/　
　　米国DOE Joint Genome Institute (JGI)のゲノムプロジェクトhttp://www.jgi.doe.gov/JGI_microbial/html/index.html　
　　Texas A&M大学のSynechococcus elongatus 7942ゲノムプロジェクトhttp://www.bio.tamu.edu/synecho/genome.html　
　　Prochlorococcus marinus SS120ゲノムプロジェクトhttp://www.sb-roscoff.fr/Phyto/ProSS120　
　　パスツール研究所のストックセンターのPCC (Pasteur Culture Collection)http://www.pasteur.fr/recherche/banques/PCC/　
　　シアノバクテリア研究のサイト　CyanoSitehttp://www-cyanosite.bio.purdue.edu/　
　　シアノバクテリア研究のサイト　CyanoNewshttp://www.people.vcu.edu/~elhaij/cyanonews/　
5節高度好熱菌Thermus thermophilus HB8のゲノム解析　―原子生物学のモデル生物―128
　　高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクトhttp://www.thermus.org　
　　倉光研究室http://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/bio_web/lab_page/kuramitu/HP030702/research.html　
　　pETシステム（タカラ）http://bio.takara.co.jp/catalog/catalog_d.asp?C_ID=C0851　
6節超好熱菌　
1超好熱始原菌Thermococcus kodakaraensis KOD1のゲノム解析141
　　Pyrococcus abyssihttp://www-archbac.u-psud.fr/genomes/newpab/newpab.html　
　　Pyrococcus horikoshiihttp://www.bio.nite.go.jp/dogan/MicroTop?GENOME_ID=ot3_G1　
　　Pyrococcus furiosushttp://comb5-156.umbi.umd.edu/genemate/　
　　COGshttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/xindex.html　
　　微生物ゲノムhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/genomes/MICROBES/Complete.html　
　　　http://www.tigr.org/tigr-scripts/CMR2/CMRHomePage.spl　
　　　http://gib.genes.nig.ac.jp/　
2Pyrococcus horikoshii OT3及びその他のアーキアのゲノム解析151
　　DOGANhttp://www.bio.nite.go.jp/dogan/Top　
　　Entrez Genomehttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/static/a_g.html　
　　GOLDhttp://wit.integratedgenomics.com/GOLD/　
7節海洋性細菌　
2極限環境に生きる多様なBacillus属関連細菌183
　　極限微生物ゲノムデータベースhttp://www.jamstec.go.jp/jamstec-j/bio/exbase.html　
　　枯草菌 (B. subtilis)ゲノムデータベースhttp://genolist.pasteur.fr/SubtiList/　
　　B. stearothermophilusゲノムサーバーhttp://www.genome.ou.edu/bstearo.html　
8節細胞内共生細菌ブフネラ192
　　統合ブフネラゲノムデータベースiBGDhttp://buchnera.gsc.riken.go.jp　
　　KEGGデータベースhttp://www.genome.ad.jp/kegg/　
9節酵母
2分裂酵母のゲノム解析と展望214
　　分裂酵母DNAデータhttp://www.sanger.ac.uk/Projects/S_pombe/　
　　分裂酵母DNAマイクロアレイhttp://www.sanger.ac.uk/PostGenomics/S_pombe/　
　　Gene DBhttp://www.genedb.org 　
　　EMBLhttp://www.ebi.ac.uk/embl　
　　GenBankhttp://www.ncbi.nih.gov/Genbank/　
　　DDBJhttp://www.ddbj.nig.ac.jp/　
　　Fyssionhttp://pombe.biols.susx.ac.uk/　
　　Pombe PDhttps://www.incyte.com/tools/proteome/databases.jsp　
　　細胞内局在データhttp://www-karc.crl.go.jp/bio/GFP-lib/htmls1/sum.html　
3メタノール資化性酵母Pichia pastorisのゲノム解析220
　　Integrated Genomics 社 http://www.integratedgenomics.com/　
　　Genoleuvreプロジェクトhttp://www.inra.fr/Internet/Produits/clib/english/genolevu.htm　
10節糸状菌ゲノム解析の現状234
　　Cereon Genomics社http://www.cereon.com/　
　　A.nidulans第四番染色体国際コンソーシアムhttp://aspergillus-genomics.org/　
　　MITホワイトヘッドのA.nidulansゲノム解析http://www-genome.wi.mit.edu/annotation/fungi/aspergillus/　
　　ドイツMIPSのN.crassaゲノム解析http://www.mips.biochem.mpg.de/proj/neurospora/　
　　MITホワイトヘッドのN.crassaゲノム解析http://www-genome.wi.mit.edu/annotation/fungi/neurospora/　
　　TIGRのA.fumigatusゲノム解析http://www.tigr.org/tdb/e2k1/afu1/intro.shtml　
　　TIGRhttp://www.tigr.org/　
　　Elitra社（A.fumigatus）http://www.elitra.com/　
　　Gene-Alliance社（A.niger）http://www.gene-alliance.com/start1.htm　
　　産業技術総合研究所の麹菌EST解析データベースhttp://www.aist.go.jp/RIODB/ffdb/index.html　
　　産総研CBRCのGene Decoderのサイトhttp://www.genedecoder.org/　
11節病原性微生物
1腸管出血性大腸菌O157のゲノム解析247
　　 O157のゲノムに関するWeb site http://genome.gen-info.osaka-u.ac.jp/bacteria/o157/ 　
2ビブリオ　255
　　腸炎ビブリオゲノムプロジェクトhttp://www.vibrio.org/　
12節細胞性粘菌282
　　粘菌cDNA解析プロジェクトのホームページhttp://www.csm.biol.tsukuba.ac.jp/cDNAproject.html　
　　cDNA配列とその解析関係のデータベースhttp://www.csm.biol.tsukuba.ac.jp/cDNA/database.html　
　　in situハイブリダイゼーションのデータベースhttp://www.csm.biol.tsukuba.ac.jp/~tools/bin/ISH/index.html　
　　ノースウエスタン大学（米国） ゲノムアノテーション、データの検証http://dictybase.org　
　　ベイラー医科大学（米国） 配列決定配列データのアセンブリー、アノテーションhttp://dictygenome.bcm.tmc.edu　
　　ケルン大学（ドイツ）配列決定http://genome.imb-jena.de/dictyostelium　
　　大阪大学（日本） 細胞型特異的遺伝子の空間的発現パターンの解析http://www.csm.biol.tsukuba.ac.jp/~tools/bin/ISH/index.html　
　　粘菌cDNA解析プロジェクトのホームページで、この中にデータベースとして以下の２つがある。http://www.csm.biol.tsukuba.ac.jp/cDNAproject.html　
　　プリンストン大学（米国） ライブラリー作製のための各染色体の分離http://www.molbio.princeton.edu/research_facultymember.php?id=22　
　　MRC分子生物学研究所（英国） HAPPYマッピングhttp://www.mrc-lmb.cam.ac.uk:80/happy/happy-home-page.html　
　　サンガーセンター（英国） ゲノムDNAライブラリー作製http://www.sanger.ac.uk/Projects/D_discoideum　

第2章　植物のゲノム解析　　[第１章|第２章|第３章]
No.節題サイト名URLページ
1節総論302
　　ミヤコグサ・ゲノム解読　かずさDNA研究所http://www.kazusa.or.jp/ja/database.html　
　　タルウマゴヤシ・ゲノム解読　オクラホマ大学http://www.genome.ou.edu/medicago.html　
　　代謝経路の総合サイト　KEGG 　 http://www.genome.ad.jp/kegg/　
　　シロイヌナズナの代謝経路　Aracychttp://www.arabidopsis.org/tools/aracyc/　
2節イネ314
　　RGP rice genetic map http://rgp.dna.affrc.go.jp/publicdata/geneticmap2000/index.html　
　　IRGSPhttp://rgp.dna.affrc.go.jp/cgi-bin/statusdb/irgsp-status.cgi　
　　Phred/phraphttp://phrap.org/phrap.docs/phrap.html 　
　　GeneMarkhttp://opal.biology.gatech.edu/GeneMark/eukhmm.cgi　
　　INEhttp://rgp.dna.affrc.go.jp/giot/INE.html　
　　BLASThttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/　
　　Arabidopsis databaswehttp://arabidopsis.org/info/agilinks.jsp　
　　OMIMhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/Stats/mimstats.html　
3節シロイヌナズナ　
1シロイヌナズナのゲノム機能解析326
　　TAIR: The Arabidopsis Information Resource　研究情報データベースhttp://www.arabidopsis.org/　
　　TAIR　研究用リソースhttp://www.arabidopsis.org/info/2010_projects/Resources.jsp　
　　TAIR　ABRCのクローン・種子リクエストhttp://www.arabidopsis.org/abrc/　
　　TAIR　タグラインのDNAプールhttp://www.arabidopsis.org/abrc/pooled_dna.html　
　　TAIR　タグラインhttp://www.arabidopsis.org/abrc/tdna_lines.html　
　　TAIR　アレイ解析データhttp://www.arabidopsis.org/tools/bulk/microarray/analysis/index.jsp　
　　TAIR　アレイ解析データhttp://www.arabidopsis.org/info/expression/index.jsp　
　　ABRC: Arabidopsis Biological Resource Center　ストックセンターhttp://www.biosci.ohio-state.edu/~plantbio/Facilities/abrc/abrchome.htm　
　　NASC: Nottingham Arabidopsis Stock Centre　ストックセンターhttp://nasc.nott.ac.uk/　
　　NASC　タグラインhttp://seeds.nottingham.ac.uk/Nasc/action.lasso?-response=browse/browse.lasso&-token　
　　NASC　アレイ解析のデータhttp://ssbdjc2.nottingham.ac.uk/narrays/experimentbrowse.pl　
　　SASSC: The SENDAI Arabidopsis Seed Stock Center　ストックセンターhttp://www.shigen.nig.ac.jp/arabidopsis/　
　　理研バイオリソースセンター実験植物開発室　クローン・種子のリクエストhttp://www.brc.riken.go.jp/lab/epd/index.html　
　　GARNet: Genomic Arabidopsis Resource Network　研究用リソースhttp://www.york.ac.uk/res/garnet/garnet.htm　
　　タグラインプロジェクト：CSHL,GARNet Project,UK-Transposone lineshttp://atidb.cshl.org/　
　　Ecker 2010 Project　タグラインプロジェクトhttp://signal.salk.edu/tabout.html　
　　FST Project　タグラインプロジェクトhttp://flagdb-genoplante-info.infobiogen.fr/projects/fst/　
　　GABI-Kat　タグラインプロジェクトhttp://www.mpiz-koeln.mpg.de/GABI-Kat/　
　　RIKEN　タグラインプロジェクトhttp://pfgweb.gsc.riken.go.jp/projects/acds.html　
　　TMRI　タグラインプロジェクトhttp://tmri.org/pages/collaborations/garlic_files/　
　　Wisconsin Knock-Out Project　タグラインプロジェクトhttp://www.biotech.wisc.edu/Arabidopsis/　
　　シロイヌナズナタグライン共同利用システム　タグラインプロジェクトhttp://www.kazusa.or.jp/ja/plant/tagline/　
　　InsertBlast　タグライン挿入位置配列の検索http://arabidopsis.org.uk/blast.html　
　　AGRIKOLA　RNAiによる遺伝子破壊http://www.agrikola.org/　
　　TILLING　点突然変異体のスクリーニングhttp://tilling.fhcrc.org:9366/　
　　GARNet Array Services　アレイプロジェクトhttp://www.york.ac.uk/res/garnet/may.htm　
　　VIB MicroArray Facility　アレイプロジェクトhttp://www.microarrays.be/Home.htm　
　　NIDDK Biotechnology Consortium　アレイプロジェクトhttp://info.med.yale.edu/wmkeck/dna_arrays.htm　
　　CPG Workgroups　アレイプロジェクトhttp://www.plantgenomics.iastate.edu/microarray/　
　　SUNY Stony Brook DNA Microarray Facility　アレイプロジェクトhttp://www.osa.sunysb.edu/udmf/　
　　Penn Genomics Institute- Microarray facility　アレイプロジェクトhttp://www.genomics.upenn.edu/microarraycore/forms.htm　
　　SRC Microarray Facility　アレイプロジェクトhttp://microarray.imb.uq.edu.au/index.html　
　　Arabidopsis Oligonucleotide Microarrays　アレイプロジェクトhttp://www.ag.arizona.edu/microarray/　
　　SAGE: Serial Analysis of Gene Expression 　遺伝子発現解析http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/browse.cgi?view=samples&email=zdu@noble.org　
　　MPSS: Massively Parallel Signature Sequencing　遺伝子発現解析http://dbixs001.dbi.udel.edu/MPSS4/java.html　
　　CESG: The Center for Eukaryotic Structural Genomics　タンパク質構造解析http://www.uwstructuralgenomics.org/　
　　Cereon　"SNPs,InDels"http://www.arabidopsis.org/Cereon/index.html　
　　Affimetrixhttp://www.affymetrix.com/index.affx　
　　Agilenthttp://www.chem.agilent.com/cag/country/JP/index.htm　
　　タカラバイオhttp://www.takara-bio.co.jp/　
　　かずさDNA研究所　ゲノム塩基配列と解析情報http://www.kazusa.or.jp/　
　　MIPS: Munich Information center for Protein Science　ゲノム塩基配列と解析情報http://mips.gsf.de/　
　　MIPS MATDB　遺伝子情報提供サイトhttp://mips.gsf.de/proj/thal/db/　
　　TIGR: The Insititute for Genomic Research　ゲノム塩基配列と解析情報http://www.tigr.org/　
　　TIGR: The TIGR Arabidopsis thaliana Database　遺伝子情報提供サイトhttp://www.tigr.org/tdb/e2k1/ath1/　
　　GeneMark.hmm　遺伝子発見プログラムhttp://opal.biology.gatech.edu/GeneMark/eukhmm.cgi　
　　GenScan　遺伝子発見プログラムhttp://genes.mit.edu/GENSCAN.html　
　　GRAIL　遺伝子発見プログラムhttp://compbio.ornl.gov/Grail-1.3/　
　　Exonomy　遺伝子発見プログラムhttp://www.tigr.org/software/Exonomy/　
　　Unvail　遺伝子発見プログラムhttp://www.tigr.org/software/Unveil/　
　　NetGene2　スプライスサイト予測プログラムhttp://www.cbs.dtu.dk/services/NetGene2/　
　　SplicePredictor　スプライスサイト予測プログラムhttp://bioinformatics.iastate.edu/cgi-bin/sp.cgi　
　　BLAST　類似配列検索プログラムhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/　
　　BLAST　BLASTのチュートリアルhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/Education/BLASTinfo/information3.html　
　　sim4　cDNAマッピングプログラムhttp://globin.cse.psu.edu/html/docs/sim4.html　
　　BLAT (Blast Like Alignment Tool)　DNA・アミノ酸配列マッピングプログラムhttp://www.cse.ucsc.edu/~kent/ 　
　　gap2/nap　DNA・アミノ酸配列マッピングプログラムhttp://www.tigr.org/software/ 　
2完全長cDNAエンサイクロペディアの作製と遺伝子の機能・発現解析への利用">336
　　著者URLhttp://pfgweb.gsc.riken.go.jp/index.html　
　　シロイヌナズナ完全長cDNAデータベースhttp://pfgweb.gsc.riken.go.jp/　
　　RARGE (RIKEN Arabidopsis Genome Encyclopedia)http://rarge.gsc.riken.go.jp/　

第3章　動物のゲノム解析　[第１章|第２章|第３章]
No.節題サイト名URLページ
1節線虫　346
　　統合データベース　WormBasehttp://www.wormbase.org/　
　　WormPDhttps://www.incyte.com/control/tools/proteome　
　　リンク集・文献検索　C. elegans WWW serverhttp://elegans.swmed.edu/　
　　国内C. elegans研究者コミュニティ　虫の集いhttp://www.wormjp.umin.jp/jp/index-j.html　
　　C. elegansゲノムプロジェクト　Caenorhabditis Genome Sequencing Projectshttp://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/　
　　ゲノムブラウザー　ENSEMBLhttp://www.ensembl.org/Caenorhabditis_elegans/　
　　遺伝子アノテーション　WormGeneshttp://www.wormgenes.org/　
　　変異体ストックセンター　Caenorhabditis Genetics Centerhttp://biosci.umn.edu/CGC/CGChomepage.htm　
　　遺伝子ノックアウト　The C. elegans Gene Knockout Consortiumhttp://celeganskoconsortium.omrf.org/　
　　ナショナルバイオリソースプロジェクト：線虫http://shigen.lab.nig.ac.jp/c.elegans/index.jsp?lang=japanese　
　　ORFeome　WorfDB (Vidal lab)http://worfdb.dfci.harvard.edu/　
　　in situ ハイブリダイゼーション　NEXTDB (Kohara lab)http://nematode.lab.nig.ac.jp/db/index.html　
　　プロモータートラッピング　Expression Pattern Database (Hope lab)http://129.11.204.86:591/default.htm　
　　線虫の構造　WormAtlashttp://www.wormatlas.org/index.htm　
　　C. briggsaeゲノムプロジェクト　The C. briggsae Genome Projecthttp://www.sanger.ac.uk/Projects/C_briggsae/　
　　C. briggsae統合データベース　Caenorhabditis briggsae Research Page http://wormlab.caltech.edu/briggsae/　
2節Drosophila　
1ショウジョウバエのゲノム科学354
　　ゲノム配列、cDNA配列、発現情報のデータベース：Berkeley Drosophila Genome Project (BDGP) http://www.fruitfly.org/　
　　遺伝子、突然変異体、系統、研究者、文献などの総合的データベース　FlyBase http://flybase.bio.indiana.edu/　
　　D. pseudoobscura のゲノム配列http://www.hgsc.bcm.tmc.edu/projects/drosophila/　
　　発生過程における遺伝子の機能、相互作用についての解説　Interactive Flyhttp://flybase.bio.indiana.edu/allied-data/lk/interactive-fly/aimain/1aahome.htm　
　　発生過程における遺伝子の機能、相互作用について画像、動画を主体とする解説　FlyMove http://flymove.uni-muenster.de/　
　　GAL4系統のデータベース　GETDB:国立遺伝学研究所http://flymap.lab.nig.ac.jp/~dclust/getdb.html　
　　GS系統のデータベース　GSDB: 東京都立大学http://www.comp.metro-u.ac.jp/~taigaki/gs/　
　　ストックセンター：　京都工芸繊維大学ショウジョウバエ遺伝資源センター 　Drosophila Genetic Resource Centerhttp://www.dgrc.kit.ac.jp/　
　　米国ショウジョウバエストックセンター　Bloomington Drosophila Stock Center http://flystocks.bio.indiana.edu/　
　　ハンガリーP因子挿入変異体ストックセンター　Szeged P-insertion Mutant Stock Center http://gen.bio.u-szeged.hu/stock/　
　　米国Exelixis社　EP系統ストックセンター　Exelixis Inc. EP flyStationhttp://flystation.exelixis.com/　
2ショウジョウバエのRNAi変異体バンク361
　　著者URLhttp://www.nig.ac.jp/　
3節ゼブラフィッシュ　372
　　The Sanger Institutehttp://www.sanger.ac.uk/Projects/D_rerio/　
4節ホヤ　384
　　カタユウレイボヤのゲノム情報http://genome.jgi-psf.org/ciona4/ciona4.home.html　
　　カタユウレイボヤのcDNA情報/遺伝子発現情報http://ghost.zool.kyoto-u.ac.jp/　
　　マボヤの母性cDNA情報http://www.genome.ad.jp/magest/　
5節マウスゲノムとトランスクリプトーム398
　　ClusTransのクラスターの選び方の詳細http://fantom2.gsc.riken.go.jp/fantom2/SI/sup19.pdf　
　　　http://fantom2.gsc.riken.go.jp/fantom2/SI/sup_21.pdf　
　　READ　RIKEN Expression Array Databasehttp://READ.gsc.riken.go.jp/　
　　cDNAクローンのリストhttp://READ.gsc.riken.go.jp/fantom2/　
　　　http://READ.gsc.riken.go.jp/fantom2/supplement/3/　
　　GOプロジェクトhttp://www.geneontology.org/　
　　MGIhttp://www.informatics.jax.org/　
　　　http://fantom2.gsc.riken.go.jp/　
　　　http://fantom2.gsc.riken.go.jp/fantom2/SI/sup16_go.pdf　
　　　http://fantom2.gsc.riken.go.jp/metabolome/　
　　　http://fantom2.gsc.riken.go.jp/supplement/disease_genes/　
6節ラットゲノム解析408
　　　http://rgd.mcw.edu/　
　　　http://ratmap.gen.gu.se/　
　　　http://www.anim.med.kyoto-u.ac.jp/model/　
　　　http://www10.ocn.ne.jp/~trans-a/　
　　　http://www.gsc.riken.go.jp/j/group/thememouseJ.html　
　　　http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide/rat/index.html　
　　　http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/map_search.cgi?chr=rat.inf　
　　　http://www.ensembl.org/Rattus_norvegicus/　
　　　http://bacpac.chori.org/　
　　　http://ratmap.ims.u-tokyo.ac.jp/　
　　　http://ratmap.ims.u-tokyo.ac.jp/menu/RH.html　
　　　http://rgd.mcw.edu/RHMAPSERVER/　
　　　http://www.chem.agilent.com/cag/country/jp/products/PDS2433.htm　
　　　http://www.affymetrix.com/products/arrays/index.affx　
　　　http://www.t-cnet.or.jp/~ysnt/gaiyou/gaiyou.htm　
　　　http://www.md.tsukuba.ac.jp/public/LabAnimalResCNT/　
　　　http://card.medic.kumamoto-u.ac.jp/　
　　　http://www.nips.ac.jp/　
　　　http://bs.shinshu-u.ac.jp/HTML/123/shochi1.html　
7節ヒトゲノムの現状　
1ヒトゲノム解析422
　　遺伝子や文献情報　LocusLink：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/LocusLink/　
　　遺伝子や文献情報　PubMed：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed　
　　ヒトゲノム進捗状況http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/seq/HsHome.shtml　
　　他生物ゲノム情報http://trace.ensembl.org/　
　　　http://www.genoscope.cns.fr/cgi-bin/exofish.cgi　
　　ヒトゲノム解析情報　Ensembl：http://www.ensembl.org/　
　　ヒトゲノム解析情報　Univ. of Santa Cruz：http://genome.ucsc.edu/　
　　遺伝子予測プログラムhttp://digit.gsc.riken.go.jp/cgi-bin/index.cgi　
　　病気等の情報　OMIM：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=OMIM　
　　ヒトSNP情報　dbSNP：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/index.html　
　　日本人SNP情報　JSNP Database：http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp　
　　理化学研究所ゲノム科学総合研究センターhttp://hgp.gsc.riken.go.jp/top.html　
　　イギリス・Sanger Institutehttp://www.sanger.ac.uk/　
　　アメリカ・ワシントン大学ゲノムセンターhttp://genome.wustl.edu/gsc/　
　　アメリカ・JGIゲノムセンターhttp://www.jgi.doe.gov/　
　　フランス・Genoscopehttp://www.genoscope.cns.fr/　
2cDNA433
　　Unigenehttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=unigene　
　　RefSeqhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq/　
　　LocusLinkhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/LocusLink/　
3大腸菌人工染色体（Bacterialartificial chromosome:BAC）ライブラリーの構築、利用、保存と配布446
　　著者研究室ホームページ、BACライブラリー／クローンの情報や入手方法など（BACPAC Resources, Children's Hospital and Research Center at Oakland）http://bacpac.chori.org/　
　　各種生物種BACライブラリー情報http://www.genome.gov/page.cfm?pageID=10001852　
　　　http://www.nsf.gov/bio/pubs/awards/bachome.htm　
　　BACクローン名や登録などhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/clone/　
　　遺伝子名からマウスBACクローンの検索などhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/clone/clonefinder/CloneFinder.html　

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