ゲノミクス・プロテオミクスの新展開 関連Web-site集-第2編
[ 書籍概要へ戻る/ Web-site集/ 第1編|第2編|第3編|第4編 ]
No. | 節題 | サイト名 | URL | ページ |
1節 | 試料前処理法 | |||
2 | ペプチドの抽出・粗精製 | 458 | ||
ペプチドの抽出 | http://www.peptidome.org/ | |||
2節 | 微量クロマトグラフィー | 467 | ||
RefSeq | http://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq/ | |||
PIR | http://www-nbrf.georgetown.edu/ | |||
SwissProt | http://www.ebi.ac.uk/swissprot/access.html | |||
ワームベース | http://www.wormbase.org/ | |||
サンガーセンター | http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/ | |||
3節 | 二次元ゲル電気泳動 | 474 | ||
ワイリー(専門誌 ”Electrophoresis”, “Proteomics”) | http://www.wiley-vch.de/publish/dt/ | |||
ExPasy(2次元ゲル電気泳動データベースとリンク集) | http://us.expasy.org/ch2d/ | |||
BioRad(IPG、CA、泳動槽、解析ソフト、スポットカッターほか) | http://www.bio-rad.com/ | |||
アマシャムバイオサイエンス(IPG、CA、泳動槽、蛍光スキャナほか) | http://www.jp.amershambiosciences.com/ | |||
アナテック(泳動槽) | http://www.anatech.co.jp/ | |||
ディー・アール・シー(泳動槽、プレキャストゲル) | http://www.drc2002.com/ | |||
アトー(泳動槽、電源) | http://www.atto.co.jp/ | |||
Molecular Probes(蛍光染色試薬) | http://www.probes.com/ | |||
富士フィルム(蛍光スキャナ) | http://www.fujifilm.co.jp/ | |||
Phoretix(2D-PAGE画像解析ソフト) | http://www.phoretix.com/ | |||
島津製作所(ゲル内自動酵素消化装置など) | http://www.shimadzu-biotech.jp/ | |||
4節 | 質量分析 | |||
2 | 分析計 | 484 | ||
Base Peak | http://www.spectroscopynow.com/Spy/basehtml/SpyH/1,1181,4-0-0-0-0-home-0-0,00.html | |||
日本質量分析学会 | http://www.mssj.jp/ | |||
American Society for Mass Spectrometry (ASMS) | http://www.asms.org/ | |||
International Mass Spectrometry Society (IMSS) | http://www.imss.nl/ | |||
6節 | 翻訳後修飾解析 | |||
2 | プロテアソームの翻訳後修飾の解析 | 504 | ||
NetPhos 2.0 Prediction Server | http://www.cbs.dtu.dk/databases/PhosphoBase/ | |||
NMT | http://mendel.imp.univie.ac.at/myristate/SUPLpredictor.htm | |||
YinOYang1.2 Prediction Server | http://www.cbs.dtu.dk/services/YinOYang/ | |||
The Sulfinator | http://kr.expasy.org/tools/sulfinator/ | |||
7節 | 発現プロファイル解析の基礎技術と方法(比較解析法、データベース構築) | |||
1 | 二次元電気泳動によるタンパク質ディファレンシャル解析とプロテオームデータベースンパク質 | 527 | ||
東京都老人総合研究所の TMIG-2DPAGE データベース | http://proteome.tmig.or.jp/2D/ | |||
Swiss Institute of Bioinformaticsの SWISS-2DPAGE データベース | http://us.expasy.org/ch2d/ | |||
University of Siena のSIENA-2DPAGE データベース | http://www.bio-mol.unisi.it/2d/2d.html | |||
Max Planck Institute for Infection Biology のProteome 2D-PAGE データベース | http://www.mpiib-berlin.mpg.de/2D-PAGE/ | |||
Purkyne Military Medical Academy のPMMA-2DPAGE データベース | http://www.pmma.pmfhk.cz/ | |||
Danish Centre for Human Genome Research の 2D PAGE データベース | http://proteomics.cancer.dk/ | |||
German Heart Institute の RAT HEART-2DPAGE データベース | http://www.mpiib-berlin.mpg.de/2D-PAGE/RAT-HEART/2d/ | |||
German Heart Institute の HUMAN HEART-2DPAGE データベース | http://userpage.chemie.fu-berlin.de/~pleiss/dhzb.html | |||
Harefield Hospital Heart Science Centre の HSC-2DPAGE データベース | http://www.harefield.nthames.nhs.uk/nhli/protein/ | |||
Max Delbruck Center の HP-2DPAGE データベース | http://www.mdc-berlin.de/~emu/heart/ | |||
Oregon Health & Science University の LENS-2DPAGE データベース | http://www.ohsu.edu/2d/2d.html | |||
ExPASy Proteomics tools サーバー | http://us.expasy.org/tools/ | |||
Matrx Science の Mascot Search サーバー | http://www.matrixscience.com/search_form_select.html | |||
UCSF の ProteinProspector サーバー | http://prospector.ucsf.edu/ | |||
2 | ペプチドの分離:高速液体クロマトグラフィーと2次元クロマトグラフィー | 532 | ||
ペプチドの分離 | http://www.peptidome.org |
No. | 節題 | サイト名 | URL | ページ |
3節 | タンパク質の安定性とフォールディング | 705 | ||
DSC: Reference Lists: | http://www.microcalorimetry.com/ | |||
タンパク質熱力学データベース:ProTherm: | http://www.rtc.riken.go.jp/jouhou/Protherm/protherm.html | |||
5節 | タンパク質の相互作用 (方法論として) | |||
1 | 表面プラズモン共鳴、カロリメトリー | 714 | ||
表面プラズモン共鳴 (ビアコア社) | http://www.biacore.co.jp | |||
カロリメトリー (MicroCal社) | http://www.microcalorimetry.com | |||
2 | two-hybrid法(酵母) | 719 | ||
Database of Interacting Proteins | http://dip.doe-mbi.ucla.edu/ | |||
PathCalling Yeast Interactin Database | http://portal.curagen.com/extpc/com.curagen.portal.servlet.Yeast | |||
Yeast Interacting Protein Database | http://genome.c.kanazawa-u.ac.jp/Y2H/ | |||
4 | タンパク質複合体の解析法:ヒトリボソーム生合成前駆体の解析を例として | 729 | ||
MS-Fit | http://jpsl.ludwig.edu.au/ucsfhtml3.4/msfit.htm | |||
酵母リボソーム生合成トランス作用因子 | http://www.expasy.org/linder/proteins.html |
No. | 節題 | サイト名 | URL | ページ |
1節 | タンパク質の相互作用解析 | 739 | ||
タンパク質相互作用データベース | http://bind.ca/ | |||
2節 | イネゲノム機能解明のためのプロテオーム解析 | 747 | ||
RICE PROTEOME DATABASE | http://gene64.dna.affrc.go.jp/RPD/ | |||
3節 | ラン藻 | 753 | ||
Cyano2Dbase | http://www.kazusa.or.jp/cyano/cyano2D/ | |||
Cyanobase | http://www.kazusa.or.jp/cyano/ | |||
Protein Prospector | http://prospector.ucsf.edu/ | |||
MS-Fit | http://prospector.ucsf.edu/ucsfhtml4.0/msfit.htm | |||
4節 | シロイヌナズナ | 760 | ||
Arabidopsis mitochondrial proteome project | http://www.gartenbau.uni-hannover.de/genetik/AMPP | |||
Arabidopsis seed proteome | http://seed.proteome.free.fr/laboratory.htm | |||
Swiss2D-PAGE | http://us.expasy.org/ch2d/ | |||
Arabidopsis membrane protein library | http://www.cbs.umn.edu/arabidopsis/ | |||
5節 | バイオセンサを用いたタンパク質相互作用解析 | 765 | ||
表面プラズモン共鳴センサ | http://www.biacore.co.jp | |||
6節 | プロテオミクスの新しいツールとしてのRFHR二次元電気泳動法--大腸菌への適用 | 772 | ||
http://www.osaka-med.ac.jp/deps/phy/index.htm |