ゲノミクス・プロテオミクスの新展開 関連Web-site集-第4編
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第4編 応用─産業・医科学における展開
第1章 産業における展開
No.節題サイト名URLページ
1節ケモ・バイオインフォマテクスと創薬研究949
   http://www.spotfire.com/ 
2節タンパク質の相互作用解析による創薬標的探索956
  DIP (Database of Interacting Proteins)http://dip.doe-mbi.ucla.edu/952
  Protein-Protein-Interaction and Complex Viewerhttp://mips.gsf.de/proj/yeast/CYGD/interaction/ 
  Yeast Interacting Proteins Databasehttp://genome.c.kanazawa-u.ac.jp/Y2H/ 
  Yeast Protein Linkage Map datahttp://depts.washington.edu/sfields/yplm/data/ 
  SPiD (Bacillus subtilis Protein Interaction Database)http://www-mig.jouy.inra.fr/bdsi/SPiD/ 
  Mouse Protein-Protein interactionshttp://genome.gsc.riken.go.jp/ppi/ 
  Human herpesvirus 1 Protein-Protein interactionshttp://www.stdgen.lanl.gov/cgi-bin/pp.cgi?dbname=hhv1 
  BIND ( Biomolecular Interaction Network Databasehttp://www.bind.ca/ 
  BRITE - Biomolecular Relations in Information Transmission and Expressionhttp://www.genome.ad.jp/brite/brite.html 
  GRID- A Database of Genetic and Physical Interactionshttp://biodata.mshri.on.ca/grid/servlet/Index 
  PathDBhttp://www.ncgr.org/pathdb/ 
  PathCalling http://curatools.curagen.com/pathcalling_portal/index.htm 
  PIM Database http://pim.hybrigenics.com/pimrider/pimriderlobby/PimRiderLobby.jsp 
  ProNethttp://www.myriad.com/ 
  (株)日立製作所酵母ツーハイブリッド解析HPhttp://www.hitachi.co.jp/LS/prot/ppnet.html956
3節創薬研究におけるプロテオミクス966
  GeneProt社http://www.geneprot.com 
  HUPOhttp://www.hupo.org/ 
  Cellzomehttp://www.cellzome.com 
  MDS Proteomics社http://www.mdsp.com 
5節酢酸菌981
  RIOGENEhttp://www.riogene.lncc.br/ 
6節放線菌 (2次代謝産物生産における遺伝子情報の活用)992
  ゲノム情報:http://avermitilis.ls.kitasato-u.ac.jp 
  ゲノム情報:http://www.sanger.ac.uk/Projects/S_coelicolor/ 
  ゲノム情報:http://mbgd.genome.ad.jp/htbin/MBGD_whole_html.pl?spec=sma 
  ゲノム情報:http://mbgd.genome.ad.jp/htbin/MBGD_whole_html.pl?spec=sco 
  ゲノム情報:http://gib.genes.nig.ac.jp/single/index.php?spid=Save_MA4680 
  ゲノム情報:http://gib.genes.nig.ac.jp/single/index.php?spid=Scoe_A3 
  解析法:http://www.nih.go.jp/~jun/research/ 
  データーベース:http://www.npbiogene.com/ 
  データーベース:http://www.genome.ad.jp/kegg/ 
7節畜産、食品の例   
1乳酸菌のゲノム解析について997
  Lactococcus lactis subsp. lactis IL1403ゲノムに関するサイトhttp://gib.genes.nig.ac.jp/single/main.php?spid=Llac_IL1403 
  Lactobacillus plantarum WCFS1ゲノムに関するサイトhttp://www.cmbi.kun.nl/lactobacillus/ 
  Bifidobacterium longum NCC2705ゲノムに関するサイトhttp://gib.genes.nig.ac.jp/single/main.php?spid=Blon_NCC2705 
  Joint Genome Institute/Lactic Acid Bacteria Genome Consortiumのサイトhttp://www.jgi.doe.gov/ 
3糸状菌ゲノム情報の産業利用1008
  MITホワイトヘッドのfungal genome initiative プログラムhttp://www.wi.mit.edu/seq/fgi/ 
  Gene-Alliance 社(A.niger)http://www.gene-alliance.com/start1.htm 

第2章 医科学における展開 [第1章|第2章|第3章]
No.節題サイト名URLページ
1節薬理ゲノミクスによる創薬ターゲット探索研究1016
  循環器薬データベースhttp://www.jscr.medic.mie-u.ac.jp/ 
2節創薬開発のためのプロテオミクス技術ー定量的・機能的プロテオミクス1027
  Proteomics tools for mining sequence databases in conjunction with Mass Spectrometry experimentshttp://prospector.ucsf.edu/ 
  Mascot Searchhttp://www.matrixscience.com/search_form_select.html 
  RefSeq databasehttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq/ 
3節SNPs1034
  形質マッピングhttp://genstat.net/ 
  ヒトゲノムドラフトhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 
  ヒトゲノムドラフトhttp://genome.ucsc.edu/ 
4節マイクロサテライトマーカーを用いた疾患遺伝子の同定1042
  UCSC Genome Bioinformatics http://genome.ucsc.edu/ 
  Sanger Institutehttp://www.sanger.ac.uk/ 
  National Center for Biotechnology Informationhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 
5節マイクロシステムとその医科学分野への応用1054
  マイクロマシンhttp://www.mmc.or.jp/ 
  MEMS                  http://www.trimmer.net/ 
  DNAチップ http://biotech.nikkeibp.co.jp/SENMON/DNACHIP/index.html  
  ハイスループットスクリーニング(HTS) http://biotech.nikkeibp.co.jp/SENMON/HTS/index.html 
6節病態解析へのタンパクレベルでのアプローチ、ゲノム医科学解析1061
  アトー(株)http://www.atto.co.jp/ 
  NonLinear Dynamicshttp://www.phoretix.com/index.htm 
  サーモエレクトロン(株)http://www.thermoelectron.jp/ 
7節大規模マウスミュータジェネシスプロジェクト1070
  Sanger Institite Mouse Genome Serverhttp://www.ensembl.org/Mus_musculus/ 
  The ENU-Mouse Mutagesis Screen(ドイツ)http://www.gsf.de/ieg/groups/enu-mouse.html 
  MRC Mammalian Genesis Unit Mutagenesis Programmes(イギリス)http://www.mgu.har.mrc.ac.uk/mut.html 
  A Large Scale mutagenesis Project in Riken GSC(日本)http://www.gsc.riken.go.jp/Mouse 
  The Jackson Laboratory neuroscience Mutagenesis Facility(アメリカ)http://nmf.jax.org/ 
  The Jackson Laboratory Mouse Heart,Lung,Blood and Sleep Disorders Center(アメリカ)http://pga.jax.org/index.html 
  Mouse Mutagenesis for Development Defectshttp://www.mouse-genome.bcm.tmc.edu/ENU/MutagenesisProj.asp 
  Tennessee Mouse Genome Consortium Neuromutagenesis Project(アメリカ)http://www.tnmouse.org/neuromutagenesis/ 
  Center for Modeling Human Disease(カナダ)http://www.cmhd.ca/ 

第3章 ゲノムバイオロジーとナノバイオテクノロジー [第1章|第2章|第3章]
No.節題サイト名URLページ
1節マイクロチップ・DNA一分子解析技術  
1マイクロチップ・DNA一分子解析技術1077
  本研究室http://www-pclab.ph.tokushima-u.ac.jp/ 
2節DNAチップ 1093
  Affymetrix社(USA)http://affymetrix.com 
  Stanford大学Brown研究室(USA):http://cmgm.stanford.edu/pbrown/array.html 
  Nanogen社(USA):http://www.nanogen.com 
  CombMatrix社(USA):http://www.combimatrix.com/ 
  TUM-gene社(日本):http://www.tum-gene.com/ 
  GeneOhm Sciences社(USA):http://www.geneohm.com/ 
  Sequenom社(USA):http://www.sequenom.com/ 
  Luminex社(USA):http://www.luminexcorp.com/ 
  Illumina社(USA):http://www.Illumina.com/ 
3節プロテインバイオチップ  
1バキュロウイルスを利用した膜タンパク質の発現とプロテインチップへの応用1100
  トランスクリプトームhttp://www.lsbm.org/ 
3ChiP-on-chip法1109
  GEOhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ 
  ArrayExpresshttp://www.ebi.ac.uk/arrayexpress 
   http://web.wi.mit.edu/young/ 
   http://genome-www5.stanford.edu// 
   http://everythingchromosomevi.gsc.riken.go.jp/ 
  MIAME GUIDE LINEhttp://www.mged.org/ 
4節マイクロ化学・生化学分析システム(micro-Total Analytical System, μ-TAS) 1117
   http://www.shimadzu-biotech.jp/ 
   http://www.an.shimadzu.co.jp/products/lcms/psiport.htm 
   https://solutions.shimadzu.co.jp/solnavi/solnavi.htm 
6節DNAマイクロビーズテクノロジー 
1MPSSによる絶対的遺伝子発現プロファイリング1138
  マイクロビーズアレイ技術紹介 タカラバイオ(株)http://www.takara-bio.co.jp/ 
  MPSS技術紹介 Lynx Therapeutics,Inchttp://www.lynxgen.com/wt/home.php3 
  MPSSデータ集 the public MPSS databaces and librarieshttp://mpss.dbi.udel.edu/ 
2ビーズを用いた計測技術1144
  Illuminahttp://www.illumina.com 
  Luminex社http://www.luminexcorp.com/ 
8節バイオベンチャー企業によるゲノム産業創生1158
   http://www.biotech.nikkeibp.co.jp 
   http://www.bio.org 
   http://www.biotechrepoot2003.com 
   http://www.biocentury.com 

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