ゲノミクス・プロテオミクスの新展開　関連Web-site集-第４編
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第4編　応用─産業・医科学における展開
第1章　産業における展開
No.節題サイト名URLページ
1節ケモ・バイオインフォマテクスと創薬研究949
　　　https://www.spotfire.com/　
2節タンパク質の相互作用解析による創薬標的探索956
　　DIP (Database of Interacting Proteins)https://dip.doe-mbi.ucla.edu/952
　　Protein-Protein-Interaction and Complex Viewerhttps://mips.gsf.de/proj/yeast/CYGD/interaction/　
　　Yeast Interacting Proteins Databasehttps://genome.c.kanazawa-u.ac.jp/Y2H/　
　　Yeast Protein Linkage Map datahttps://depts.washington.edu/sfields/yplm/data/　
　　SPiD (Bacillus subtilis Protein Interaction Database)https://www-mig.jouy.inra.fr/bdsi/SPiD/　
　　Mouse Protein-Protein interactionshttps://genome.gsc.riken.go.jp/ppi/　
　　Human herpesvirus 1 Protein-Protein interactionshttps://www.stdgen.lanl.gov/cgi-bin/pp.cgi?dbname=hhv1　
　　BIND ( Biomolecular Interaction Network Databasehttps://www.bind.ca/　
　　BRITE - Biomolecular Relations in Information Transmission and Expressionhttps://www.genome.ad.jp/brite/brite.html　
　　GRID- A Database of Genetic and Physical Interactionshttps://biodata.mshri.on.ca/grid/servlet/Index　
　　PathDBhttps://www.ncgr.org/pathdb/　
　　PathCalling https://curatools.curagen.com/pathcalling_portal/index.htm　
　　PIM Database https://pim.hybrigenics.com/pimrider/pimriderlobby/PimRiderLobby.jsp　
　　ProNethttps://www.myriad.com/　
　　（株）日立製作所酵母ツーハイブリッド解析HPhttps://www.hitachi.co.jp/LS/prot/ppnet.html956
3節創薬研究におけるプロテオミクス966
　　GeneProt社https://www.geneprot.com　
　　HUPOhttps://www.hupo.org/　
　　Cellzomehttps://www.cellzome.com　
　　MDS Proteomics社https://www.mdsp.com　
5節酢酸菌981
　　RIOGENEhttps://www.riogene.lncc.br/　
6節放線菌　（2次代謝産物生産における遺伝子情報の活用）992
　　ゲノム情報：https://avermitilis.ls.kitasato-u.ac.jp　
　　ゲノム情報：https://www.sanger.ac.uk/Projects/S_coelicolor/　
　　ゲノム情報：https://mbgd.genome.ad.jp/htbin/MBGD_whole_html.pl?spec=sma　
　　ゲノム情報：https://mbgd.genome.ad.jp/htbin/MBGD_whole_html.pl?spec=sco　
　　ゲノム情報：https://gib.genes.nig.ac.jp/single/index.php?spid=Save_MA4680　
　　ゲノム情報：https://gib.genes.nig.ac.jp/single/index.php?spid=Scoe_A3　
　　解析法：https://www.nih.go.jp/~jun/research/　
　　データーベース：https://www.npbiogene.com/　
　　データーベース：https://www.genome.ad.jp/kegg/　
7節畜産、食品の例　　　
1乳酸菌のゲノム解析について997
　　Lactococcus lactis subsp. lactis IL1403ゲノムに関するサイトhttps://gib.genes.nig.ac.jp/single/main.php?spid=Llac_IL1403　
　　Lactobacillus plantarum WCFS1ゲノムに関するサイトhttps://www.cmbi.kun.nl/lactobacillus/　
　　Bifidobacterium longum NCC2705ゲノムに関するサイトhttps://gib.genes.nig.ac.jp/single/main.php?spid=Blon_NCC2705　
　　Joint Genome Institute/Lactic Acid Bacteria Genome Consortiumのサイトhttps://www.jgi.doe.gov/　
3糸状菌ゲノム情報の産業利用1008
　　MITホワイトヘッドのfungal genome initiative プログラムhttps://www.wi.mit.edu/seq/fgi/　
　　Gene-Alliance 社（A.niger）https://www.gene-alliance.com/start1.htm　

第２章　医科学における展開　[第１章|第２章|第３章]
No.節題サイト名URLページ
1節薬理ゲノミクスによる創薬ターゲット探索研究1016
　　循環器薬データベースhttps://www.jscr.medic.mie-u.ac.jp/　
2節創薬開発のためのプロテオミクス技術ー定量的・機能的プロテオミクス1027
　　Proteomics tools for mining sequence databases in conjunction with Mass Spectrometry experimentshttps://prospector.ucsf.edu/　
　　Mascot Searchhttps://www.matrixscience.com/search_form_select.html　
　　RefSeq databasehttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq/　
3節SNPs1034
　　形質マッピングhttps://genstat.net/　
　　ヒトゲノムドラフトhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/　
　　ヒトゲノムドラフトhttps://genome.ucsc.edu/　
4節マイクロサテライトマーカーを用いた疾患遺伝子の同定1042
　　UCSC Genome Bioinformatics https://genome.ucsc.edu/　
　　Sanger Institutehttps://www.sanger.ac.uk/　
　　National Center for Biotechnology Informationhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/　
5節マイクロシステムとその医科学分野への応用1054
　　マイクロマシンhttps://www.mmc.or.jp/　
　　MEMS　　　　　　　　　　　　　　　　　　https://www.trimmer.net/　
　　DNAチップ https://biotech.nikkeibp.co.jp/SENMON/DNACHIP/index.html 　
　　ハイスループットスクリーニング(HTS) https://biotech.nikkeibp.co.jp/SENMON/HTS/index.html　
6節病態解析へのタンパクレベルでのアプローチ、ゲノム医科学解析1061
　　アトー（株）https://www.atto.co.jp/　
　　NonLinear Dynamicshttps://www.phoretix.com/index.htm　
　　サーモエレクトロン(株)https://www.thermoelectron.jp/　
7節大規模マウスミュータジェネシスプロジェクト1070
　　Sanger Institite Mouse Genome Serverhttps://www.ensembl.org/Mus_musculus/　
　　The ENU-Mouse Mutagesis Screen（ドイツ）https://www.gsf.de/ieg/groups/enu-mouse.html　
　　MRC Mammalian Genesis Unit Mutagenesis Programmes（イギリス）https://www.mgu.har.mrc.ac.uk/mut.html　
　　A Large Scale mutagenesis Project in Riken GSC(日本)https://www.gsc.riken.go.jp/Mouse　
　　The Jackson Laboratory neuroscience Mutagenesis Facility(アメリカ)https://nmf.jax.org/　
　　The Jackson Laboratory Mouse Heart,Lung,Blood and Sleep Disorders Center(アメリカ)https://pga.jax.org/index.html　
　　Mouse Mutagenesis for Development Defectshttps://www.mouse-genome.bcm.tmc.edu/ENU/MutagenesisProj.asp　
　　Tennessee Mouse Genome Consortium Neuromutagenesis Project(アメリカ)https://www.tnmouse.org/neuromutagenesis/　
　　Center for Modeling Human Disease(カナダ)https://www.cmhd.ca/　

第３章　ゲノムバイオロジーとナノバイオテクノロジー　[第１章|第２章|第３章]
No.節題サイト名URLページ
1節マイクロチップ・ＤＮＡ一分子解析技術　　
1マイクロチップ・ＤＮＡ一分子解析技術1077
　　本研究室https://www-pclab.ph.tokushima-u.ac.jp/　
2節ＤＮＡチップ　1093
　　Affymetrix社（USA)https://affymetrix.com　
　　Stanford大学Brown研究室（USA）：https://cmgm.stanford.edu/pbrown/array.html　
　　Nanogen社（USA)：https://www.nanogen.com　
　　CombMatrix社（USA)：https://www.combimatrix.com/　
　　TUM-gene社（日本）：https://www.tum-gene.com/　
　　GeneOhm Sciences社（USA）：https://www.geneohm.com/　
　　Sequenom社（USA)：https://www.sequenom.com/　
　　Luminex社（USA）：https://www.luminexcorp.com/　
　　Illumina社（USA）：https://www.Illumina.com/　
3節プロテインバイオチップ　　
1バキュロウイルスを利用した膜タンパク質の発現とプロテインチップへの応用1100
　　トランスクリプトームhttps://www.lsbm.org/　
3ChiP-on-chip法1109
　　GEOhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/　
　　ArrayExpresshttps://www.ebi.ac.uk/arrayexpress　
　　　https://web.wi.mit.edu/young/　
　　　https://genome-www5.stanford.edu//　
　　　https://everythingchromosomevi.gsc.riken.go.jp/　
　　MIAME GUIDE LINEhttps://www.mged.org/　
4節マイクロ化学・生化学分析システム(micro-Total Analytical System, μ-TAS) 1117
　　　https://www.shimadzu-biotech.jp/　
　　　https://www.an.shimadzu.co.jp/products/lcms/psiport.htm　
　　　https://solutions.shimadzu.co.jp/solnavi/solnavi.htm　
6節ＤＮＡマイクロビーズテクノロジー　
1MPSSによる絶対的遺伝子発現プロファイリング1138
　　マイクロビーズアレイ技術紹介　タカラバイオ(株)https://www.takara-bio.co.jp/　
　　MPSS技術紹介　Lynx Therapeutics,Inchttps://www.lynxgen.com/wt/home.php3　
　　MPSSデータ集　the public MPSS databaces and librarieshttps://mpss.dbi.udel.edu/　
2ビーズを用いた計測技術1144
　　Illuminahttps://www.illumina.com　
　　Luminex社https://www.luminexcorp.com/　
8節バイオベンチャー企業によるゲノム産業創生1158
　　　https://www.biotech.nikkeibp.co.jp　
　　　https://www.bio.org　
　　　https://www.biotechrepoot2003.com　
　　　https://www.biocentury.com　

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